پایان نامه برای دریافت درجه کارشناسی ارشد(M.Sc)
گرایش: علوم سلولی و مولکولی
عنوان:
بررسی پلی مورفیسمT) 509C–)، ژن TGF-β1 در بیماران مبتلا به ریفلاکس وزیکویورترال(VUR) به روش PCR-RFLP در استان کرمان
استاد راهنما:
جناب آقای دکتر محمد رضا بذر افشانی
سال تحصیلی:93-1392
برای رعایت حریم خصوصی نام نگارنده پایان نامه درج نمی شود
(در فایل دانلودی نام نویسنده موجود است)
تکه هایی از متن پایان نامه به عنوان نمونه :
(ممکن است هنگام انتقال از فایل اصلی به داخل سایت بعضی متون به هم بریزد یا بعضی نمادها و اشکال درج نشود ولی در فایل دانلودی همه چیز مرتب و کامل است)
عنوان فهرست مطالب شماره صفحه
چکیده فارسی…………1
فصل اول: کلیات تحقیق
1-1 ریفلاکس وزیکویورترال(VUR) 3
1-2 شیوع VUR. 4
1-3 سبب شناسی VUR. 5
1-4 VUR از منظر کلینیکی. 6
1-5 نشانه شناسی VUR. 10
1-6 پروگنوزیس VUR. 10
1-7 روش های تشخیصیVUR. 10
1-7-1 سونوگرافی. 11
1-7-2 سیستوگرام در حال ادرار(MCUG or VCUG) 11
1-7-3سیستوگرافی تخلیه ای رزونانس مغناطیسیMRVCUG 12
1-7-4 سیستوگرافی رادیو نوکلئویدRNC 12
1-7-5 سیستوگرافی رادیونوکلئوید مستقیم DRC. 13
1-7-6 سیستوگرافی رادیونوکلئوید غیر مستقیمIRC. 14
1-8بهبود خود به خود VUR. 15
1-9 درمان ریفلاکس وزیکویورترال. 16
1-9-1 پیشگیری آنتی بیوتیکی. 16
1-9-2 جراحی باز 17
1-9-3 تزریق آندوسکوپی. 17
1-10 VURفامیلی. 18
1-11 شناسایی یک ژن یا لوکوس ویژه مرتبط با VUR. 19
1-11-1 uroplakin. 20
1-11-2 SLIT2/ROBO2. 20
1-11-3 Transforming growth factor-β1. 20
1-12 اصول کلی واکنش زنجیره ای پلیمراز 25
1-12-1 مواد مورد نیاز برای واکنش PCR. 26
1-13 آنالیز PCR-RFLP. 27
1-14روش های آنالیز برای مطالعات وابستگی SNP. 28
1-15 اهمیت موضوع. 29
1-16 فرضیه های مطالعه 31
1-17 هدف از مطالعه 31
فصل دوم: مروری بر متون گذشته
2-1 بررسی ارتباط پلی مورفیسم ژن TGF-β1 با VUR فامیلی. 34
فصل سوم: مواد و روش ها
3-1 نوع مطالعه 37
3-2 جامعه مورد مطالعه 38
3-2-1 گروه بیمار 38
3-2-2 گروه سالم 38
3-3 نمونه‌گیری. 38
3-4 متغیرهای تحقیق. 38
3-5 استخراج DNA. 39
3-6 اندازه گیری کیفیت و غلظت DNA. 40
3-7 دستورالعمل PCR برای نشانگر PCR-RFLP. 41
3-7-1 طراحی پرایمرها اختصاصی برای تعیین SNP. 41
3-7-2 dNTPs 41
این مطلب را هم بخوانید :
3-7-3 کلرید منیزیم(MgCl2) 42
3-7-4 بافر واکنش PCR. 42
3-7-5 آنزیم Taq Polymerase. 42
3-7-6 آب دوبار تقطیر شده استریل. 42
3-8 راه اندازی واکنش PCR. 42
3-9 برنامه دمایی PCR. 43
3-10 الکتروفورز ژل آگارز 43
3-10-1مواد لازم الکتروفورز ژل آگاروز2%.. 43
3-10-2 طرز تهیه ژل آگارز 2%.. 43
3-10-3طرز تهیه بافر TBE 1X. 44
3-10-4طرز تهیه اتیدیوم‌برماید 44
3-11 هضم آنزیمی. 44
3-12 روش تجزیه و تحلیل داده ها : 45
3-13بررسی تعادل هاردی-واینبرگ. 46
3-14 آزمون كای دو )رابطه بین دو متغیر كیفی) 47
3-15 روش آماری. 47
3-16 آزمون استقلال کای اسکوئر 47
3-17آزمون نیکویی برازش کای اسکوئر 47
3- 18 انحراف معیار از میانگین (SE, SEM) 48
فصل چهارم: نتایج
4-1 نتایج هضم آنزیمی. 50
4-2مقایسه ی توزیع فراوانی پلی مورفیسم ژن TGFB1 در كودكان مبتلا به ریفلاكس وزیكویورترال با كودكان سالم 51
4-3نحوه آنالیز ژنوتیپ های CC،TC و TT. 52
4-3-1 آنالیز ژنوتیپ های CC،TC وTT در دو گروه بیماران مبتلا به ریفلاكس وزیكویورترال و گروه كنترل زمانیكه ژنوتایپ CCبه عنوان مرجع (رفرنت ) باشد. 52
4-3-2 آنالیز ژنوتیپ های CC،TC و TT در دو گروه بیماران مبتلا به ریفلاكس وزیكویورترال و گروه كنترل زمانیكه ژنوتایپ TT به عنوان مرجع (رفرنت ) باشد. 54
4-4 آنالیز آلل های T و C در دو گروه كودكان مبتلا به ریفلاكس وزیكویورترال و كودكان سالم (گروه كنترل) 55
4-5 بررسی تعادل هاردی واینبرگ در گروه كودكان مبتلا به ریفلاكس وزیكویورترال. 57
4-6 بررسی تعادل هاردی واینبرگ در گروه كودكان سالم (كنترل) 58
4-7 انحراف معیار از میانگین. 59
فصل پنجم: بحث و نتیجه گیری
5-1 پیشنهادات: 65
منابع 66
خلاصه انگلیسی. 70
عنوان فهرست اشکال شماره صفح
شکل1-1 سیستم درجه بندی مطالعه جهانی ریفلاکس……………………………………………………………………………………………..3
شکل2-1 اتصال یوترووزیکال………………………………………………………………………………………………………………………………………..4
شکل3-1 نمایی از کانال حالب درون دیواره مثانه……………………………………………………………………………………………………….7
شکل4-1 مثال های کلینیکی از مطالعه ریفلاکس………………………………………………………………………………………………………9
شکل5-1 VCUG در کودک 4 ساله نشان دهده برگشت دو طرفه ادرار ……………………………………………………………….12
شکل6-1 نقشه ژن TGF-beta1 انسانی……………………………………………………………………………………………………………………23
شکل7-1 تصویر شماتیک نحوه انجام PCR ……………………………………………………………………………………………………………26
شکل8-1 روش های آنالیز برای مطالعات وابستگی SNP ……………………………………………………………………………………….29
شکل1-3 تصویر مربوط به بررسی نتیجه استخراج DNA روی ژل آگارز………………………………………………………………..40
شکل1-4 قطعه حاصل از تکثیر پی سی آر (808 جفت باز)…………………………………………………………………………………..50
شکل2-4 سه ژنوتیپ حاصل از هضم آنزیم……………………………………………………………………………………………………………….50
عنوان فهرست جداول شماره صفحه
جدول1-1 ژنها و مکان های ژنی بالقوه دخیل در تکامل کلیه و یا مثانه …………………………………………………………………..24
جدول 1-3 مربوط به متغیرهای تحقیق…………………………………………………………………………………………………………………….39
جدول 2-3 پرایمرها اختصاصی…………………………………………………………………………………………………………………………………..41
جدول 3-3 مواد و مقادیر لازم برای واکنش هضم آنزیمی یک نمونه………………………………………………………………………..45
جدول 4-3 محاسبه مرحله به مرحله ژنوتیپ های مورد انتظار………………………………………………………………………………..46
جدول 1-4 فراوانی ژنوتیپ های CC،TC و TT…………………………………………………………………………………………………….51
جدول 2-4 فراوانی ژنوتایپ های CC،TC و TT…………………………………………………………………………………………………53
جدول 3-4 آزمون کای اسکوئر در دو گروه كودكان مبتلا به ریفلاكس و كودكان سالم………………………………………….53
جدول 4-4 تخمین ریسک برای هنگامی که cc رفرنت فرض شده………………………………………………………………………….53
جدول5-4 فراوانی ژنوتایپ های CC،TC و TT …………………………………………………………………………………………………..54
جدول6-4 آزمون کای اسکوئر ژنوتیپ TT رفرنت در نظر گرفته می شود………………………………………………………………54
جدول 7-4 تخمین ریسک برای هنگامی که TT رفرنت فرض شده………………………………………………………………………..55
جدول8-4 فراوانی آلل های T و C…………………………………………………………………………………………………………………………….55
جدول9-4آزمون کای اسکوئر برای بررسی آلل های Tو C……………………………………………………………………………………….56
جدول10-4 تخمین ریسک برای آلل ها TوC………………………………………………………………………………………………………….56
جدول11-4 فراوانی ژنوتیپ های مشاهده شده و مورد انتظار در گروه كودكان مبتلا به ریفلاكس وزیكویورترال…………………………………57
جدول12-4 آزمون کای اسکوئر نیکویی برازش برای بررسی HWE در كودكان مبتلا …………………………………………58
|
[چهارشنبه 1399-07-02] [ 02:46:00 ق.ظ ]
|
